Le 2 décembre 1851, Louis-Napoléon Bonaparte déclencha un coup d’Etat qui lui permit de se défaire de l’Assemblée législative, qui refusait de modifier la Constitution pour lui permettre de briguer un second mandat. Le 21 décembre, un plébiscite vint ratifier les mesures prises par le président de la République. Le 14 janvier 1852, le « prince-président » promulgua une nouvelle Constitution autoritaire, prélude au rétablissement de l’Empire.

Baudin fut l’un des rares députés républicains à prendre les armes contre le coup d’Etat de Louis-Napoléon Bonaparte. Il fut tué sur la barricade du faubourg Saint-Antoine.